院办公室：
1.研究生院日常行政管理、综合协调、对外接待工作；
2.研究生院各类综合性材料的起草、汇总、印发及行政公文处理工作；
3.统筹各类经费预算编报、预算执行管理；
4.研究生院对外宣传、信息发布、数据统计与报送工作；
5.研究生教育管理内控体系及文化建设工作；
6.研究生院网站运行及维护；
7.研究生院党务、工会、人事、档案、资产等管理工作。
研究生招生办公室：
1.负责各类研究生招生计划管理，制定和申报工作；
2.负责硕士、博士研究生招生简章、招生专业目录制定工作；
3.负责硕士、博士研究生报名、命题、初试、阅卷、复试、录取等组织工作；
4.负责推荐免试研究生、直博生的接收工作；
5.负责组织开展各类研究生线上、线下招生宣传、夏令营等咨询活动；
6.负责哈尔滨工程大学考点建设、全国研究生招生考试考务组织工作；
7.负责组织实施各类研究生选拔机制改革；
8.负责受理各类研究生招生申诉等特殊事宜；
9.负责研究生招生管理系统、网站及公众号的维护等招生信息化建设工作，落实研究生招生信息公开。
专业学位教育办公室：
1.国家卓越工程师学院建设；
2.龙江工程师学院建设；
3.高端智能装备产教融合育人联盟秘书处；
4.黑龙江省工程师学会秘书处；
5.工程硕博士校企联合培养项目建设、管理及评估；
6.政校企资源拓展与联合培养机制建设；
7.专业学位研究生培养模式改革推进；
8.专业教育与职业发展贯通；
9.产教融合联合培养基地平台建设；
10.专业实践入企实践管理与评价；
11.特色专业学位课程与教材建设；
12.龙江产教融合信息服务平台建设；
13.专业学位改革推广、学位与研究生教育研究工作；
14.其他有关工程硕博士培养资源拓展相关工作。
培养工作办公室：
1.负责制定或修订研究生培养工作管理的规章制度及改革措施；
2.负责研究生培养方案管理，含各专项研究生；
3.负责平台级合作关系统筹规划与管理；
4.负责推进烟青琼一体化培养计划、课程体系建设管理；
5.负责研究生教育教学改革；
6.负责研究生教学质量监控与保障体系建设；
7.负责研究生课程考核管理及成绩管理；
8.负责研究生培养事故认定与处理；
9.负责研究生思政系列建设；
10.负责研究生教材建设与管理；
11.负责研究生课程建设与管理；
12.负责研究生课程运行管理服务；
13.负责学术学位研究生（含中外）培养环节管理服务；
14.研究生考试违纪处理；
15.负责进修学生对接、课程、成绩、学费管理。
国际交流办公室：
1.负责开展研究生教育国际化研究和国际化教育教学体系建设；
2.负责研究生教育国际化导师队伍建设、联合培养方案审定、学术成果共享、学位联授等工作；
3.负责研究生国家公派留学等出国交流项目管理与宣传服务工作；
4.负责推动学院同国（境）内外高水平高校联合培养、学术交流等事宜；
5.负责研究生赴国（境）外交流、中外联合培养相关实施办法、管理制度的制订；
6.负责海外优质课程引进、与国外高水平学者共建课程及管理。
学位工作办公室：
1.学位授权点的申报工作；
2.学位授权点合格评估、专项评估及动态调整工作；
3.导师遴选、培训及日常管理；
4.校学位评定委员会和分委员会管理；
5.论文开题、中期考核等培养流程的管理；
6.研究生学位授予工作管理（学位论文校内抽查评估、毕业生图像采集、开具毕业证明及学位证明）；
7.毕业证书及学位证书；
8.博导、专家信息数据统计上报，学信网学历、学位信息注册及信息管理；
9.各级学位论文抽检；
10.学术不端管理、学位论文质量保证体系建设；
11.校优秀博士学位论文遴选；一级学科/学会优秀学位论文推荐工作；
12.研究生信息化建设。
思想教育管理办公室：
（一）思政教育模块
1.拟定与实施全校研究生思想政治教育工作计划，指导培养单位开展研究生思政教育、管理和服务工作；
2.研究生安全稳定与意识形态工作；
3.研究生违纪事件处理与突发事件处置；
4.研究生迎新工作、毕业离校工作，组织开展入学教育、毕业教育及各类专题教育工作；
5.研究生重大活动组织工作；
6.研究生学风建设工作、学术氛围营造工作，组织开展研究生各类学术科技活动、创新实践竞赛活动等；
7.指导开展导师师德师风建设与研工工作队伍建设；
8.研究生学生组织指导工作；
9.研究生评奖评优工作；
10.协同学校有关部门做好研究生心理健康教育、宿舍管理、社会实践、毕业研究生的就业创业指导和服务等工作。
（二）学籍奖助模块
1.研究生学籍管理工作（学籍核查、注册、数据维护、统计报送等）；
2.研究生学籍异动处理工作（保留、放弃入学资格、保留学籍、休学、复学、结业换证、退学、转导师等）；
3.研究生奖助体系建设工作；
4.各类研究生奖助学金评定发放工作；
5.博导助研津贴定义、收取及发放工作；
6.导师基础研究基金评选工作；
7.研究生博创基金评定管理工作；
8.研究生学籍奖助全过程管理服务信息化建设工作；
9.异地非全过程研究生培养备案工作。